Nach einer Staupeerkrankung heilen einige normal aus, bei anderen treten jedoch Nachwirkungen auf. Ein häufiges Verdauungsproblem ist, dass der Verdauungstrakt des Hundes nach der Heilung geschwächt ist, was zu einer Malabsorption führen kann. Zweitens können neurologische Symptome wie Kopfschütteln und unkontrollierbares Zittern der Gliedmaßen auftreten. Es gibt auch einige, die zur Entwicklung von Lungenläsionen führen können.
