Der Border Collie wird in der Regel 30-45 Tage nach der Geburt abgestillt, da die meisten Hündinnen nicht in der Lage sind, bis zu zwei Monate lang zu säugen. In dieser Zeit müssen die Besitzer ihre Welpen mit nassem Hundefutter füttern, wobei sie nach Möglichkeit Welpenfutter wählen und das Futter mit warmem Wasser oder Ziegenmilch aufweichen sollten. Im Alter von fast zwei Monaten ist der Hund vollständig entwöhnt und die Wassermenge im Futter muss schrittweise reduziert werden. Erst im Alter von 3 bis 4 Monaten beginnt der Border Collie-Welpe mit dem Zahnwechsel, und es ist an der Zeit, auf Trockenfutter umzusteigen, auf dem er viel kauen muss, damit sich die Zähne des Hundes entwickeln können. Nach der Entwöhnung ist der Darm des Border Collies noch nicht vollständig entwickelt und die Milchzähne sind noch nicht vorhanden, so dass Trockenfutter beim Welpen wahrscheinlich Magen-Darm-Probleme verursacht, die in schweren Fällen zu Durchfall oder Erbrechen führen können, was für den Welpen sehr gefährlich sein kann. Das Abwarten des Zahnwechsels bis zum dritten oder vierten Lebensmonat, bevor mit der Fütterung von Trockenfutter begonnen wird, kann ebenfalls die Symptome von juckenden und schmerzenden Zähnen lindern, aber auch der Zeitpunkt der Umstellung muss angepasst werden, insbesondere bei Welpen mit schlechtem Magen-Darm-Trakt, so dass die Fütterung von Trockenfutter entsprechend verzögert werden kann.
