Das Mikrovirus befällt vor allem den Magen-Darm-Trakt und kann sehr schädlich sein; in der Regel entwickelt es sich innerhalb einer Woche nach der Infektion. SCT führt bei Hunden zu Appetitlosigkeit, begleitet von Erbrechen, Durchfall, meist in Form von Strahlen oder Blut im Stuhl, in schweren Fällen zu Dehydrierung und schließlich zum Schock mit einer hohen Sterblichkeitsrate bei Welpen. Bei erwachsenen Hunden ist die Inzidenz sehr gering, und sie zeigen in der Regel keine offensichtlichen Symptome, sondern nur einen gewissen fischigen Geruch im Kot und eine Appetitlosigkeit, die nicht behandelt werden muss, wenn sie nicht schwerwiegend ist. Mit Mikroviren infizierte Hunde können klinisch als Enteritis oder Myokarditis klassifiziert werden. Die wichtigste Erscheinung der Enteritis ist Fieber, das bis zu 40 °C oder mehr betragen kann. Beim Myokarditis-Typ können plötzlich Atemnot und Herzversagen auftreten.
